Объясните настройки звука в Media Player Classic
 

Что значит пункт, выделенный красным? Я понимаю, что в окошке нужно указать число каналов в аудиодорожке. Или же в нём нужно указать имеющиеся каналы вывода (наушники, две колонки или система 5.1)?

это
но я бы не стал трогать, если у вас верно подключено и вы ни чего местами не меняли

Чего там менять местами? Это разве настройка не для того, чтобы многоканальная аудиодорожка правильно распределялась на имеющиеся два канала вывода?

Скорее наоборот. Стерео дорожка правильно распределялась на многоканальный колонки.

на скрине, так то показано что у вас 6 каналов и 6 колонок.
Эта надстройка для того чтобы, если не стандартная схема подключения или расположения колонок, то тут можно выставить все в нужном порядке.
В принципе, можно и многоканальную дорожку распределить на стерео, но встроенный драйвер самостоятельно вроде не плохо справляется